Baggeren houdt in dat een laag bagger van de waterbodem verwijderd wordt. Deze laag bagger bestaat voornamelijk uit bladresten en zand dat in de loop der jaren in het water terecht is gekomen. Het werk wordt uitgevoerd met schuifboten en graafmachines. De bagger die uit het water wordt geschept, wordt aan de waterkant in vrachtwagens geladen en afgevoerd naar plaatsen waar de bagger vaak weer nuttig toegepast kan worden. Bijvoorbeeld als grond of bij het ondieper maken van voormalige zandwinputten.